四川省玉溪河灌区管理处成立于1975年，隶属于四川省水利厅，2008年根据四川省水利厅川水函[2008]43号文更名为四川省玉溪河灌区管理局，2021年根据川编办发[2021]124号文更名为四川省玉溪河灌区运管中心，管辖玉溪河引水工程取水枢纽、51.5公里主干渠、百丈水库和38公里的百丈水库左、右干渠。下设5个水利站、3个电站和10个职能部门。